الكنيسة الأرثوذكسية اليابانية ، وهي هيئة مستقلة للكنيسة الأرثوذكسية الشرقية ، في علاقة قانونية مع بطريركية موسكو ، والتي تؤكد انتخاب عاصمة طوكيو. تم إنشاء الكنيسة الأرثوذكسية اليابانية بجهود المبشر البارز ، نيكولاي كاساتكين (1836-1912) ، الذي أصبح أول رئيس أساقفة أرثوذكسي في اليابان وطوب قديسًا في عام 1970.
منذ بداية البعثة (1872) ، لم تكن الكنيسة تعتمد على أفراد التبشير الأجانب. يُرسم الكهنة اليابانيون بعد تدريبهم في أحد المعاهد الدينية في طوكيو ، وتسيطر مجموعة من رجال الدين والعلمانيين على شؤون الكنيسة. سمحت هذه الشخصية الأصلية للأرثوذكسية اليابانية لها بالبقاء على قيد الحياة العديد من المحاكمات السياسية وفترات العزلة ، مثل الحرب الروسية اليابانية والحربين العالميتين. بين عامي 1945 و 1970 كانت الكنيسة تحت السلطة الكنسية للمتروبوليتان الروسية الأمريكية. في عام 1970 تلقت تشريعًا مستقلاً دائمًا من بطريركية موسكو ، كنيستها الأم. الكاتدرائية الأرثوذكسية في طوكيو - تسمى كاتدرائية نيكولاي ، لمؤسسها ، نيكولاي كاساتكين - هي واحدة من أكبر المباني الدينية في العاصمة اليابانية. تضم الكنيسة ، التي يبلغ عدد أعضائها حوالي 30.000 عضو ، أبرشيات في طوكيو وكيتو وسينداي.
